Tuy nhiên, trong quá trình triển khai thực hiện CVĐ, tùy vào điều kiện cụ thể mà mỗi đơn vị có những thuận lợi, khó khăn khác nhau. Đối với các đơn vị Hải quân trên quần đảo Truờng Sa, CVĐ xây dựng MTVH là một nhu cầu bức thiết cần phải giải quyết, nhưng để triển khai thực hiện tốt CVĐ cũng phải vượt qua rất nhiều khó khăn. Bởi lẽ, Trường Sa là quần đảo nằm xa đất liền nhất trong số các đảo trên biển Việt Nam. Là một bộ phận lãnh thổ của nước ta, song Trường Sa vốn là nơi nhạy cảm về chính trị, kinh tế và văn hóa, luôn tiềm ẩn nguy cơ đe dọa độc lập, chủ quyền quốc gia, dân tộc. Chính vì lẽ đó, cuộc đấu tranh bảo vệ vững chắc chủ quyền biển, đảo luôn luôn là một yêu cầu thiêng liêng, một trách nhiệm lớn lao mà cán bộ, chiến sĩ nơi đây luôn phải duy trì, thực hiện bằng được. ở Trường Sa, thời tiết, khí hậu rất khắc nghiệt, là trung tâm của các cơn bão lớn, môi trường biển mặn làm cho vũ khí, trang bị và các tiện nghi sinh hoạt xuống cấp nhanh chóng, ảnh hưởng đến khả năng chiến đấu và sinh hoạt của bộ đội. Do ở xa đất liền, nên công tác bảo đảm, chi viện cho đảo gặp rất nhiều khó khăn; mọi hoạt động chiến đấu, sẵn sàng chiến đấu(SSCĐ), huấn luyện và các hoạt động khác của bộ đội mang tính độc lập cao. Điều đáng lưu tâm là, cuộc sống của cán bộ, chiến sĩ trên quần đảo mang tính biệt lập, tách rời đời sống thường nhật trong đất liền; các mối liên hệ với xã hội và gia đình chủ yếu gián tiếp thông qua các phương tiện truyền thông; điều kiện xây dựng MTVH theo các tiêu chí của trên còn nhiều bất cập. Trước sự phát triển mạnh mẽ của đời sống xã hội thì những băn khoăn, trăn trở về bản thân, gia đình, cuộc sống, xã hội, chi phối đến tâm tư, tình cảm của bộ đội là điều khó tránh khỏi... Đặc điểm đó đã và đang làm cho CVĐ xây dựng MTVH của các đơn vị Hải quân đóng quân trên quần đảo Truờng Sa đứng trước những khó khăn, thử thách mới, đòi hỏi lãnh đạo, chỉ huy các cấp phải phát huy tính chủ động, sáng tạo, khắc phục khó khăn, phấn đấu thực hiện có hiệu quả cao những nội dung chính của CVĐ cũng như những tiêu chuẩn của một đơn vị có MTVH tốt theo qui định của trên; xây dựng các đơn vị Hải quân trên quần đảo Trường Sa trở thành những đơn vị vững về bản lĩnh chính trị, mạnh về phòng thủ, tốt về lối sống, đẹp về cảnh quan.